公司法人借款加盖公章的依据是，法人代表借款后，加盖公司公章的，视为公司对外举债，由公司承担还款责任。借款协议属于合同的性质，在借款协议上，可以加盖合同专用单，也可以加盖单位公章。
【法律依据】
根据《民法总则》规定，企业法人对它的法定代表人和其他工作人员的经营活动，承担民事责任。